오버플로우 인터럽트 발생 조건은 TOP(TCNT1=0x3FF) 입니다.
OCR1x값의 Update는 BOTTOM(TCNT1=0) 입니다.
OCR1A의 갱신은 비교매치 인터럽트에서 하는 것이 좋겠죠
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// MCU BASIC: https://www.basic4mcu.com
// DateTime : 2018-06-14 오전 9:28:21
// by Ok-Hyun Park
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16비트 타이머 카운터 PWM 에서  TCCR1A 레지스터의 COM1A0 COM1A1 비트를 조합해서
PORTB.5 로 비교일치시마다  원하는 펄스의 형태를 출력할수가 있는것을  알고있습니다.
그런데 제가 생각했을때 꼭 이 PORTB.5 만을 이용해서 1개의 LED의 밝기를 제어하는것보다
타이머/카운터의 TIFR 레지스터의  OCF1A 비교일치 플래그 와 TOV1 오버플로우 플래그를
이용해서 다른 포트로도 PWM 출력을 낼수있게 하려고 코드를 생각해보았습니다.
아래 코드에서 16비트 타이머/카운터의 FAST PWM TOP=1024 를 사용하였으며 분주비는 64이고 
cnt가 244가되었을때 NUM 이 1 증가하여서 1초간격으로 NUM 의 값이 1씩 증가하며
그때마다 switch 문을통해서 OCR1A 의 값을 변경해 줍니다.
그리고 main 함수에서 TIFR레지스터를 활용해서 OCF1A 플래그가 1이되었을때 
즉 비교일치가 되었을때는 PORTB.0=1 로 LED를 꺼주고(참고로 LED가 SINK 구동방식입니다.)
오버플로우가 되었을시에는 TOV 플래그가 1이되었을때 PORTB.0=0 을 주므로써 LED 를 켜줍니다.
그리고 플래그를 확인하고 난뒤에는 강제로 TIFR레지스터의 해당 플래그 에 1을 삽입해주므로써 CLEAR를 시켜줍니다.
(중복동작을 방지하기위해서)
그런데 생각했던것과는다르게 작동이 되지않는데 어느부분이 잘못된것인지 알려주시면 감사하겠습니다.
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#include <mega128.h>
#include <delay.h>
int cnt=0;
int NUM=0;
//
interrupt [TIM1_OVF] void timer1_ovf_isr(void){ // 오버플로우 인터럽트
  PORTB.0=0;
}
//
interrupt[TIM1_COMPA]void timer1_compare(void){ // 4.096ms
  PORTB.0=1;
  if(++cnt>=244){ cnt=0; // 1000ms/4.096ms=244.140625
    if(++NUM>3)NUM=0;
    switch(NUM){
      case 0: OCR1A=1023; break;
      case 1: OCR1A= 999; break;
      case 2: OCR1A= 850; break;
      case 3: OCR1A=   1; break;
    }
  }
}
//
void main(void){
  DDRB=0x01;
  TCCR1A=0x03; TCCR1B=0x0B; TIMSK=0x14; //주기=16000000/64/1024=244.140625Hz=4.096ms
  SREG=0x80;
  while(1){}
}