void main(void){
  UINT SW,OLD_SW;
  DDRA=0xFF;           // A 포트 모든 핀 출력 설정
  PORTA=0xFF;          // 모든 LED 초기값 OFF
  DDRB=0xFF;           // B 포트 모든 핀 출력 설정
  DDRF=0xF0;           // PF4-PF7 출력 설정
  DDRE=0x02;           // PE 포트 입력 설정(PE1 출력)<--??0x02로 설정된 이유가 궁금합니다.혹시 몰라 0xFF로 변경해보았을때 스위치가 작동하지 않았습니다.
  OLD_SW=(~PINE>>4)&3; // SW8 상태값 추출<--??(~PINE>>4)&3의 의미가 정확이 어떤 의미인지 잘 모르겠습니다.
  TCCR1B=0x09; OCR1A=9999;
  while(1){
    PORTF=~0x80; PORTB=FND[d1]; delay_us(2450);
    PORTF=~0x40; PORTB=FND[d2]; delay_us(2450);
    PORTF=~0x20; PORTB=FND[d3]; delay_us(2450);
    PORTF=~0x10; PORTB=FND[d4]; delay_us(2450);
    SW=(~PINE>>4)&3;
    if(SW!=OLD_SW){
      OLD_SW=SW;
      if(SW&1){
        Run^=1; // SW8?<--?Run^=1 의 의미를 잘 모르겠습니다.인터넷에도 정확한 설명이 잘 나오지 않아 부탁드립니다.
      }
    }
 
  DDRE=0x02;           // PE 포트 입력 설정(PE1 출력)<--??0x02로 설정된 이유가 궁금합니다.혹시 몰라 0xFF로 변경해보았을때 스위치가 작동하지 않았습니다.
이 코드는 원래 질문소스에 들어있던 것 아닌가요?
회로도도 없고 PE1의 핀 설명이 없어서 알 수가 없으므로 그냥 나둔겁니다.
저에게 물어보면 안되겠죠..
필요없으면 삭제하세요
 
UART0 사용하는 경우에 TXD0를 출력으로 설정한다고 저렇게 설정하는 경우가 있는데
UART 설정만 하면 자동으로 TXD핀 출력이 결정되므로 사용자가 출력으로 설정할 필요가 없습니다.
//
비트 연산을 공부해야 합니다.
  OLD_SW=(~PINE>>4)&3; // SW8 상태값 추출<--??(~PINE>>4)&3의 의미가 정확이 어떤 의미인지 잘 모르겠습니다.
~는 비트반전 연산자입니다.
0은 1로 바꾸고, 1은 0으로 바꿉니다.

Run^=1; 
^는 XOR 연산자입니다.
Run XOR 1 하면 RUN이 0이면 1로 되고, 1이면 0으로 됩니다.
특정 비트만 선택적으로 반전 시킬 수 있습니다.
 
>> 우 쉬프트 연산자입니다.
& AND 연산자입니다.